El agua en los aljibes se contamina por la presencia de elementos orgánicos como maderas, palos, ramas, hojas y pasto, así como insectos que entran por las rendijas o ranuras alrededor de la tapadera del aljibe. La temperatura dentro del aljibe es ideal como medio de cultivo para un gran número de bacterias y otros microorganismos (Legionella sp, E. coli, Clostridium, coliformes, enterococos, etc.) por eso cuenta con el allmantenimiento para su Limpieza.
